В природной воде особенно в глубинных скважинах в больших количествах содержится растворенное (двухвалентное) железо и часто марганец. В поверхностных водах  железо уже окислено до трехвалентного состояния содержания их в воде составляет 0,3 мг/л для железа и 0,1 мг/л для марганца (СанПиН 2.1.4.1074-01). Для промышленных производств значения по содержанию в воде железа и марганца гораздо жестче (в зависимости от типа производства). Железо в воде находится в следующих формах:

• Двухвалентное – растворенное в виде ионов Fe⁺².
• Трехвалентное – не растворенное в виде осадков, взвесей Fe⁺³.
• Органическое железо – в виде различных растворимых комплексов.
• Бактериальное железо – продукт жизнедеятельности железобактерий.

В качестве фильтрующих материалов используют:

• BIRM – горная порода содержащая диоксид марганца.
• Greensand – пористый цеолит в структуру которого введен марганец.
• Осадочные материалы с применением предварительного окисления железа.

Примеры обезжелезивания:

Метод1: предварительно воду насыщают кислородом для чего используют напорную и безнапорную аэрацию. Насыщение воды кислородом происходит при помощи компрессора, нагнетать кислород можно как в напорную колонну, так и в емкость (при высоком содержании двух валентного железа). Для осаждения окисленного железа используют следующие фильтрующие материалы – BIRM, Pyrolox,  Кварцевый песок, Дробленый антрацит, Filter AG (обладает высокой грязеемкостью). Регенерация фильтрующих материалов производится обратным потоком воды без добавления реагентов.

Метод 2: в качестве окислителей используется гипохлорит натрия (NaClO) или перманганат калия (KMnO₄), для окисления железа и марганца используют комплексы пропорционального дозирования, далее окисленное железо осаждается на осадочных фильтрах с фильтрующими материалами - Pyrolox,  Кварцевый песок, Дробленый антрацит, Filter AG, Greensand. Регенерация фильтрующих материалов производится обратным потоком воды без добавления реагентов.

Метод 3: в качестве окислителя и осадочного фильтра используется фильтрующий материал Greensand, который является сам окислителем за счет введенного в его пористую структуру марганца. Так же Greensand имеет способность окислять и осаждать сероводород. Данный метод имеет не достаток в том, что необходимо постоянно следить за содержанием перманганата калия в марганцовочном баке, так как регенерация фильтрующего материала требует концентрированного раствора перманганата калия для восстановления окислительных способностей материала.

Для удаления сероводорода из воды, как правило, используют аэрацию, либо окислители, используемые в процессах обезжелезивания.